Kê khai hóa đơn GTGT mua vào là bước bắt buộc để doanh nghiệp được khấu trừ thuế, với thời hạn nộp là ngày 20 tháng sau kỳ tính thuế. Theo Tổng cục Thuế, việc kê khai đúng hạn giúp doanh nghiệp tránh được mức phạt lên đến 20% số thuế chậm nộp.
Điểm cốt lõi về kê khai hóa đơn GTGT mua vào
- Thời hạn nộp: ngày 20 tháng sau kỳ tính thuế
- Cần có: hóa đơn, chứng từ, sổ sách kế toán
- Tỷ lệ khấu trừ: 100% cho chi phí kinh doanh
- Không được khấu trừ: xe du lịch dưới 9 chỗ, tiền lãi ngân hàng
Các bước kê khai từ nhận hóa đơn đến nộp tờ khai

- Bước 1: Thu thập hóa đơn mua vào – Thu thập đầy đủ hóa đơn GTGT mua vào trong tháng, kiểm tra thông tin người bán, số tiền, thuế suất. Theo Cục Thuế Hà Nội, doanh nghiệp cần lưu trữ hóa đơn gốc và bản sao có chứng thực trong vòng 5 năm.
-
Bước 2: Kiểm tra thông tin – Đối chiếu hóa đơn với chứng từ thanh toán, đảm bảo có đủ chữ ký, đóng dấu của người bán.
Cần kiểm tra mã số thuế người bán có khớp với cơ sở dữ liệu của Tổng cục Thuế hay không.
- Bước 3: Lập tờ khai – Sử dụng mẫu 01/GTGT hoặc phần mềm HTKK để lập tờ khai thuế GTGT mua vào. Tờ khai cần thể hiện rõ số tiền, thuế suất và số thuế được khấu trừ.
- Bước 4: Nộp qua mạng hoặc trực tiếp – Nộp tờ khai qua cổng thông tin điện tử hoặc tại chi cục thuế trước ngày 20. Nếu nộp trễ hạn, doanh nghiệp sẽ bị phạt chậm nộp theo quy định tại khoản 1 Điều 8 Nghị định 125/2020/NĐ-CP.
-
Bước 5: Lưu trữ chứng từ – Lưu trữ hóa đơn, chứng từ thanh toán, tờ khai đã nộp ít nhất 5 năm.
Cần sắp xếp theo tháng, quý để dễ tra cứu khi có yêu cầu kiểm tra của cơ quan thuế.
Mẫu biểu và file mềm cần thiết cho kê khai
Để kê khai hóa đơn GTGT mua vào, doanh nghiệp cần chuẩn bị mẫu 01/GTGT theo Thông tư 78/2014/TT-BTC. Phần mềm HTKK phiên bản 3.4.0 hỗ trợ kê khai trực tuyến, tự động tính toán số thuế được khấu trừ.
Các file đính kèm bao gồm: bảng kê hóa đơn mua vào, chứng từ thanh toán, sổ sách kế toán. Theo Cục Thuế Hà Nội, việc sử dụng phần mềm HTKK giúp giảm 70% thời gian kê khai so với phương pháp thủ công. Ngoài ra, doanh nghiệp cần chuẩn bị:
- Bảng kê hóa đơn mua vào theo mẫu số 01-1/GTGT
- Chứng từ thanh toán qua ngân hàng (hóa đơn điện tử có mã của cơ quan thuế)
- Sổ sách kế toán ghi chép chi tiết các khoản mua vào
- Bản sao có chứng thực hóa đơn GTGT nếu nộp hồ sơ giấy
Các trường hợp đặc biệt khi kê khai hóa đơn mua vào

Xử lý hóa đơn bị sai, bị mất hoặc thiếu chữ ký
- Sai mã số thuế – Liên hệ người bán để cấp lại hóa đơn có mã số thuế đúng, nếu không được thì lập biên bản giải trình. Theo khoản 2 Điều 10 Thông tư 219/2013/TT-BTC, doanh nghiệp cần có văn bản giải trình kèm theo tờ khai.
-
Thiếu chữ ký – Yêu cầu người bán bổ sung chữ ký và đóng dấu, nếu không được thì lập tờ khai riêng kèm theo giải trình.
Cơ quan thuế sẽ xem xét từng trường hợp cụ thể để quyết định có chấp nhận khấu trừ hay không.
- Hóa đơn bị mất – Làm đơn xin xác nhận mất hóa đơn, kèm theo chứng từ thanh toán để được xem xét khấu trừ. Đơn xin xác nhận phải có xác nhận của cơ quan công an nơi xảy ra mất mát.
- Đơn xin xác nhận – Nộp đơn xin xác nhận cho cơ quan thuế khi không có hóa đơn gốc nhưng có chứng từ thanh toán hợp lệ. Cơ quan thuế có thể chấp nhận khấu trừ nếu có đủ căn cứ chứng minh đã phát sinh giao dịch mua bán.
Mua hàng từ cá nhân không kinh doanh và hàng nhập khẩu

Khi mua hàng từ cá nhân không kinh doanh, doanh nghiệp cần lập hóa đơn giá trị gia tăng theo mẫu 01/GTGT. Theo quy định của Cục Thuế TP.HCM, cần có chứng từ thanh toán qua ngân hàng để được khấu trừ thuế. Trường hợp mua hàng hóa, dịch vụ từ cá nhân không kinh doanh với giá trị từ 20 triệu đồng trở lên, doanh nghiệp phải lập hóa đơn.
Đối với hàng nhập khẩu, doanh nghiệp phải có tờ khai hải quan, hóa đơn thương mại và chứng từ thanh toán quốc tế. Thủ tục hải quan yêu cầu nộp thuế GTGT trước khi thông quan, sau đó được khấu trừ khi kê khai thuế. Cụ thể:
- Có tờ khai hải quan đã được thông quan
- Hóa đơn thương mại (commercial invoice) có giá trị từ nhà cung cấp nước ngoài
- Chứng từ thanh toán quốc tế như SWIFT, tờ khai hải quan bản chính
- Giấy chứng nhận xuất xứ (nếu có) để được hưởng ưu đãi thuế
Lỗi thường gặp và cách khắc phục khi kê khai hóa đơn GTGT
Các lỗi kê khai phổ biến và mức phạt
- Sai số tiền – Sai lệch số tiền trên hóa đơn so với thực tế thanh toán, mức phạt từ 1-5 triệu đồng theo điểm a khoản 2 Điều 12 Nghị định 125/2020/NĐ-CP. Cần đối chiếu kỹ trước khi lập tờ khai.
-
Thiếu chữ ký – Hóa đơn không có chữ ký và đóng dấu của người bán, không được khấu trừ thuế.
Theo khoản 1 Điều 5 Thông tư 39/2014/TT-BTC, hóa đơn phải có chữ ký và đóng dấu của người bán.
- Sai mã số thuế – Mã số thuế người bán không khớp với cơ sở dữ liệu của Tổng cục Thuế, cần xác minh lại. Lỗi này khiến hóa đơn không hợp lệ để khấu trừ thuế.
- Không có chứng từ thanh toán – Thiếu chứng từ thanh toán qua ngân hàng, không được khấu trừ thuế theo quy định tại khoản 3 Điều 6 Thông tư 219/2013/TT-BTC. Cần lưu giữ sao kê ngân hàng, giấy báo có.
-
Nộp tờ khai trễ hạn – Nộp sau ngày 20, bị phạt chậm nộp bằng 0,03%/ngày tính trên số thuế chậm nộp.
Nếu chậm từ 90 ngày trở lên, mức phạt tăng lên 0,05%/ngày.
Sử dụng phần mềm HTKK để tránh sai sót
Phần mềm HTKK phiên bản 3.4.0 giúp doanh nghiệp kê khai hóa đơn GTGT mua vào chính xác hơn. Sau khi cài đặt, doanh nghiệp nhập thông tin hóa đơn mua vào, phần mềm tự động tính toán số thuế được khấu trừ và lập tờ khai mẫu 01/GTGT.
Lợi ích của phần mềm bao gồm: giảm sai sót do nhập liệu, tự động cập nhật quy định mới nhất, lưu trữ dữ liệu an toàn. Theo khuyến nghị của Tổng cục Thuế, doanh nghiệp nên cập nhật phiên bản mới nhất để đảm bảo tương thích với hệ thống của cơ quan thuế. Các bước cài đặt và sử dụng:
- Tải phần mềm HTKK từ trang web của Tổng cục Thuế
- Cài đặt theo hướng dẫn, đảm bảo tương thích với hệ điều hành Windows
- Nhập thông tin doanh nghiệp, mã số thuế, thông tin tài khoản khai thuế điện tử
- Nhập dữ liệu hóa đơn mua vào theo từng tháng
- Sử dụng chức năng kiểm tra dữ liệu trước khi nộp tờ khai
Kê khai hóa đơn GTGT mua vào đúng quy định không chỉ giúp doanh nghiệp được khấu trừ thuế đầy đủ mà còn tránh được rủi ro phạt. Sử dụng phần mềm HTKK và kiểm tra kỹ trước khi nộp là cách hiệu quả nhất để đảm bảo chính xác. Để hiểu rõ hơn về các quy định liên quan đến hóa đơn VAT, doanh nghiệp có thể tham khảo các hướng dẫn chi tiết từ cơ quan thuế.

